1959年 东北林学院林业机械系正式成立，首任系主任刘文龙，以原属采运系的采伐及运输专业为主，新组建了营林机械、木材加工机械专业，首届招收本科生128名。

1960年 林业机械系在原有三个专业的基础上新增设了五个专业，按当时的形势要求，建立起尖端专业和尖端教研室，无线电设计与制造、自动学与动力学、林区动力装置被确定为尖端专业。

1966年 林业机械系创业初见成效，相继出版了多部教材，建成了传热学、电工学、电力拖动与控制、电机、精密仪器、金相、热处理、机械零件、机械原理、营林机械、电器设备、金属喷镀、发动机等实验室，实验课的开出率达到了80%。

1968年 林业机械系随东北林学院一起迁往黑龙江省伊春市带岭林区，实行上山办学。

1973年 学校回迁哈市办学，同年7月林业机械系开始恢复招生（工农兵学员）

1976年 学校在原有系的基础上划分成小系，林业机械系一分为三，分成运修系、林机系、木机系。

1977年 恢复全国统一高考，重新开始招收正式参加全国高考的高中毕业生。

1978年 恢复研究生招生，两个专业共招收4名研究生。

1979年 学校停止了当年分小系的工作方向，与采运系合并为采运与机械系。

1980年 再度恢复了独立的林业机械系。

1982年 李屺瞻晋升为教授，成为林业机械系的首位教授。

1984年 经国家学位委员会批准，“林业与木工机械”确定为硕士学位授权点。

1984年 经林业部批准成立林业部木工机械质量检测监督中心（站），该中心很长一段时间挂靠在林业机械系，以林业机械系教师为骨干力量，为林业木工行业的服务做出了重要的贡献。

1989年 经林业部批准更名为机电工程系。

1992年“林业与木工机械”学科被确定为林业部重点学科。

1993年“林业与木工机械”学科被批准为博士学位授权点。增设了“林业自动化”和“汽车运用工程”两个硕士学位授权点。

1995年 经原林业部批准正式建立了机电工程学院。

1997年 全国专业学科目录调整，我院三个学科分别调整为“林业机械及理论”、“控制理论与控制工程”和“载运工具运用工程”。

1999年 学校重新调整专业划分，由我院“计算机科学与技术”专业和其它学院的相关专业组建了信息与计算机工程学院；同时由我院“载运工具”和“交通工程”2个专业，组建了交通运输工程学院。

2003年 国家人事部、全国博士后管委会下发文件，通知“机械工程”一级学科在东北林业大学（即在本院）设立博士后流动站。同年“农业电气化与自动化”硕士学位授权点成立。

2005年 “机械工程”一级学科硕士学位授权点成立，下设4个二级学科硕士点。

2006年 圆满完成教育部组织的对东北林业大学进行的本科教学评估工作。同年自动化专业被评为黑龙江省重点专业。

2007年 “农业机械化工程”、“检测技术与自动化装置”两个硕士学位授权点建立。

2008年 机电工程学院办公地点由原机械楼搬迁至学校主楼。

2009年 学院举行了建系五十周年的庆祝活动。

2010年 “机械工程”学科晋升为一级博士学位授权点。

2011年 学院启动全国工程教育专业认证，申报机械设计制造及自动化和自动化专业，参加全国的认证工作。同年，电子信息工程专业由信息与计算机工程学院调整至机电工程学院。

2013年 学院组织召开自动化专业认证推进会。

2014年 国务院学位委员会正式决定，将农业推广硕士定名为农业硕士。

2015年 学院由主楼搬迁至成栋楼。

2016年 国家木工机械监督检验中心划归机电工程学院。

2017年 学院增设 “电子与通信工程”专业学位硕士点。同年，自动化专业顺利通过了工程教育专业认证。

2018年 学院正式按照调整后的农业硕士专业学位培养领域 “农业工程与信息技术”开始进行招生和培养工作。

2019年 学院撤消“农业机械化”与“农业电气化”两个二级学科硕士点，新增设 “信息与通信工程”一级学科硕士点。同年，学校对学科专业结构进行调整，将机电工程学院的“电子信息”工程硕士及新增的“信息与通信工程”一级硕士学科调整到信息与计算机工程学院。同时将机电工程学院的“通信工程”、“电子信息工程”专业及其教师调整到信息与计算机工程学院。同年，机械设计制造及其自动化、电气工程及其自动化专业顺利通过了工程教育专业认证。学校成立“人工智能研究院”挂靠机电工程学院。成功举办学院成立60周年、国家木工机械质量监督检验中心成立30周年、中国林业机械协会木材加工机械分会成立30周年庆祝大会暨林业智能装备相关学科专业建设发展论坛、校友论坛系列活动。

2020年 学院牵头成立“国家林业和草原创新联盟-木工智能化国家创新联盟”。同年，机械专业学位培养领域新增“工业设计工程”方向于2021年开始招生和培养工作。车辆工程专业获批“省级一流本科专业建设点”。

2021年 学院新增“机器人工程”专业并于同年开始招生。机械电子专业顺利通过全国工程教育专业认证，机械设计制造及其自动化、电气工程及其自动化、自动化、森林工程专业4个专业获批“国家级一流本科专业建设点”，汽车服务工程专业获批“省级一流本科专业建设点”。工科教学实习中心划归机电工程学院。

2022年 机械电子工程专业获批“国家级一流本科专业建设点”，工业工程专业获批“省级一流本科专业建设点”。“现代木工机械智能化产业学院”获批黑龙江省首批现代产业学院。获批3项国家级科技小院。

2023年 学校学科专业调整，将车辆工程、汽车服务工程、森林工程、工业工程专业等四个专业及其教师调整至机电学院，将电气工程及其自动化、自动化等两个专业及其教师调整至计算机与控制工程学院，将工业设计专业及其教师调整至家居与艺术设计学院。